Антитела связываются с цитокератином 5 во многих некератинизированных многослойных плоских эпителиях, в базальных клетках желез простаты, и могут быть использованы для дифференциальной диагностики низкодифференцированной плоскоклеточной карциномы от аденокарциномы, эпителиальной мезотелиомы от метастатической карциномы плевры при использовании в составе панели антител (кальретинин, TTF-1). Антитела к цитокератину 5 также можно использовать для определения злокачественных новообразований в молочной железе и простате.